Sadeveden loppusijoitus vaikuttaa paitsi luonnollisten vesistöjen (jokien, kanavien, järvien, lampien, säiliöiden jne.) Turvallisuuteen, mutta koko viemäriverkostoon paikallisten ja alueellisten vedenkäsittelyjärjestelmien kautta. Sadeveden saastuminen johtuu pääasiassa aineista, jotka tulevat suoraan todellisesta maaperästä ja vähemmässä määrin ilmakehästä. Näin ensimmäinen kerääntynyt sademäärä osoittautuu saastuneemmaksi, koska se yhdistyy kaikkiin epäpuhtauksiin, jotka laskeutuvat maaperään kuivalla säällä.
Varastosäiliöiden käyttö on tulossa yhä laajemmaksi pyrittäessä vähentämään ympäristövaikutuksia, jotka syntyvät, kun sadevesi hävitetään luonnollisissa vesistöissä. Näiden säiliöiden tarkoituksena on kerätä ja pitää kiinni ensimmäisestä raskaan kaatosadan tuottamasta vedestä, mikä estää sen virtaamasta luonnollisiin vesistöihin hallitsemattomalla tavalla. Ensimmäisen huuhtelun sadeveden kiintoaineet kuitenkin laskeutuvat näiden säiliöiden pohjalle ja vaikeuttavat niiden hallintaa. Nämä kiinteät aineet sisältävät tiettyä orgaanista fraktiota, joka auttaa mikro-organismeja ja bakteereita lisääntymään korkean lämpötilan ja kosteuden läsnä ollessa, mikä johtaa kaasun tuotantoon ja epämiellyttäviin hajuihin. Tämä tarkoittaa, että puhdistus ja näiden sedimenttien poistaminen on ensiarvoisen tärkeää, kun kyseessä on sadevarastojen huolto.